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      小鼠ENCODE突破

      2015年05月27日 15:00:13人氣:530來(lái)源:上海研生生化試劑有限公司

      由冷泉港實(shí)驗(yàn)室(CSHL)的Thomas R. Gingeras和西班牙巴塞羅那基因組調(diào)控中心的Roderic Guigo*的一個(gè)研究小組,鑒別出了人類(lèi)和小鼠中表達(dá)水平在相對(duì)限制的范圍內(nèi)變化的6600個(gè)基因。
      他們發(fā)現(xiàn),這種表達(dá)限制與它們基因序列的相似程度無(wú)關(guān)。不論細(xì)胞的類(lèi)型,這6600個(gè)基因代表了在兩個(gè)物種的全部組織細(xì)胞中通常活化的整套基因中大約三分之一的基因。研究人員說(shuō),這項(xiàng)研究提供的新信息將繼續(xù)幫助使小鼠成為研究人類(lèi)疾病和生物學(xué)的*模式生物。

      Gingeras說(shuō):“我們發(fā)現(xiàn),進(jìn)化相當(dāng)狹窄地限制了這6600個(gè)基因的表達(dá)水平,我們認(rèn)為這反映了這些特殊的基因?qū)τ趦蓚€(gè)物種中所有組織中所有細(xì)胞的運(yùn)作均至關(guān)重要。進(jìn)化告訴了我們:不管在何種細(xì)胞類(lèi)型中表達(dá),這些基因需要限制它們的表達(dá)變化——變化增大將會(huì)高度損害基本的細(xì)胞日常運(yùn)作。細(xì)胞需要這些基因在一個(gè)相對(duì)狹窄的范圍內(nèi)運(yùn)轉(zhuǎn)確保正常地發(fā)揮功能?!?br>該研究小組鑒別出的這6600個(gè)基因在小鼠和人類(lèi)中已進(jìn)化至,不論是在乳腺組織或肺組織中;也不論是在上皮細(xì)胞或神經(jīng)細(xì)胞中,其表達(dá)在大約100倍的范圍內(nèi)變化。而剩余的三分之二的表達(dá)基因則能夠在10萬(wàn)倍以上的范圍改變它們的表達(dá)。

      此外,Gingeras和合作者們還發(fā)現(xiàn)當(dāng)比較從雞到人類(lèi)6種極為不同的動(dòng)物物種時(shí),它們?nèi)匀还餐?500個(gè)基因的表達(dá)嚴(yán)格地限制在相同的狹窄范圍內(nèi)??茖W(xué)家們說(shuō),這表明了這種調(diào)控機(jī)制在進(jìn)化上非常古老,因此極為重要。

      這些出現(xiàn)在《自然》(Nature)雜志的一篇研究論文中,并且當(dāng)前公布在生命科學(xué)預(yù)印本biorxiv.org上的研究結(jié)果,是小鼠ENCODE(DNA元件百科全書(shū))項(xiàng)目在幾家科學(xué)期刊上發(fā)布的大量研究工作的一個(gè)組成部分。這一團(tuán)體在今天發(fā)布于《自然》(Nature)雜志上的4篇研究論文中報(bào)告了一些共享研究結(jié)果。這項(xiàng)研究工作調(diào)查了參與調(diào)控小鼠和人類(lèi)基因組的一些遺傳和生物化學(xué)程序。

      同時(shí),該團(tuán)體還發(fā)現(xiàn)了一些強(qiáng)有力的線(xiàn)索解釋為什么小鼠中的一些過(guò)程和系統(tǒng),例如免疫系統(tǒng)、代謝和應(yīng)激反應(yīng)會(huì)與人類(lèi)如此的不同?;诙嗄甑男∈蠛突蛘{(diào)控研究,他們開(kāi)發(fā)出了一種資源來(lái)幫助科學(xué)家們更好地理解小鼠和人類(lèi)之間的相似和不同之處如何書(shū)寫(xiě)在它們的基因組中。
      這些研究結(jié)果有可能從整體上提供了,有關(guān)基因調(diào)控和對(duì)哺乳動(dòng)物生物學(xué)至關(guān)重要的其他一些系統(tǒng)的新見(jiàn)解。他們還提供了一些新信息確定何時(shí)以及在哪些細(xì)胞類(lèi)型和組織中,小鼠是研究人類(lèi)生物學(xué)和疾病的適當(dāng)模型,并且有可能幫助解釋它的某些局限性。這事實(shí)上是Gingeras和同事們?cè)谛抡撐闹袌?bào)告的這項(xiàng)研究工作的意義之一。

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